1、核对设计图纸
在种植水生植物前，明确好各种植物所种植的位置、面积、高度。
2、用土：除了漂浮植物不须底土外，栽植其它种类的水生植物，须用田土、池塘烂泥等有机黏质土做为底土，在表层铺盖直径一至二公分的粗砂，可防止灌水或震动造成水混浊现象。
3、施肥：以油粕、骨粉的玉肥作为基肥，约放四、五个玉肥于容器角落即可，水边植物不须基肥。追肥则以化学肥料代替有机肥，以避免污染水质，用量较一般植物稀薄十倍。在水生植物移入水池前10天施肥，施肥不应污染水质。
4、水位：水生植物依生长习性不同，对水深的要求也不同。
漂浮植物最简单，仅须足够的水深使其漂浮；沉水植物则水高必须超过植株，使茎叶自然伸展。水边植物则保持土壤湿润、稍呈积水状态。挺水植物因茎叶会挺出水面，须保持五十公分至一公尺左右的水深。浮水植物较麻烦，水位高低须依茎梗长短调整，使叶浮于水面呈自然状态为佳。
5、疏除：若同一水池中混合栽植各类水生植物，必须定时疏除繁殖快速的种类，以免覆满水面，影响睡莲或其它沉水植物的生长；浮水植物过大时，叶面互相遮盖时，也必须进行分株。及时清除枯残枝叶及杂物，对于由病虫害等原因而造成整盆死亡的，应将其空盆移出。
6、换水：为避免蚊虫孳生或水质恶化，当用水发生混浊时，即必须换水，夏季则须增加换水次数。
7、病虫害防治及防冻：养有观赏鱼的水池不允许喷对鱼类有害的农药，这类水池的水生植物有严重病虫害时，应撤出后再喷药品处理。水生植物冬季管理，对于不耐寒而干枯的水生植物，应在其冬季枯黄后将其泥上部分清除，对于多年生耐寒水生植物应在每年2月底新芽长出前泥上部分剪除。盆栽水生植物可以冬季连盆拿出水面，并在开春前补施一次基肥，待其新叶长出后再移入水中。
